More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1028 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 124 aa  259  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  86.29 
 
 		 124 aa  229  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  65.55 
 
 		 121 aa  178  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.1 
 
 		 286 aa  177  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  70.8 
 
 		 351 aa  176  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  65.52 
 
 		 169 aa  173  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.39 
 
 		 338 aa  173  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.71 
 
 		 290 aa  168  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  66.39 
 
 		 159 aa  167  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.1 
 
 		 284 aa  167  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.38 
 
 		 334 aa  167  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2423  methionine sulfoxide reductase B  64.1 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55047  normal  0.248958 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.39 
 
 		 334 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.87 
 
 		 333 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  63.72 
 
 		 119 aa  161  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  62.83 
 
 		 119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  62.83 
 
 		 119 aa  161  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.5 
 
 		 287 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.72 
 
 		 301 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.72 
 
 		 301 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.72 
 
 		 301 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  60.17 
 
 		 120 aa  156  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000598889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.83 
 
 		 301 aa  156  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.95 
 
 		 301 aa  153  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.06 
 
 		 302 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.87 
 
 		 301 aa  152  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.06 
 
 		 301 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.06 
 
 		 301 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.41 
 
 		 284 aa  150  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.41 
 
 		 284 aa  150  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.18 
 
 		 306 aa  149  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.18 
 
 		 301 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.16 
 
 		 309 aa  148  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.65 
 
 		 300 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.71 
 
 		 305 aa  147  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.18 
 
 		 301 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.29 
 
 		 305 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1329  Methionine sulfoxide reductase B  58.56 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.397039  normal  0.253282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.91 
 
 		 289 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.91 
 
 		 289 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9083  predicted protein  51.69 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  52.54 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  54.7 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  52.14 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  50.82 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  50.82 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  50.82 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  49.17 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  48.31 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  49.58 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  48.31 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  47.11 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  47.11 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  49.17 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01932  methionine-R-sulfoxide reductase SelR, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07840)  50.47 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  45.45 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  47.41 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  44.63 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  48.31 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  43.22 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  45 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  45.83 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  45 
 
 		 198 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  47.46 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  44.44 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  42.37 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  42.37 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  42.62 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  45.83 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  42.24 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  45.38 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  44.54 
 
 		 183 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  45.76 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  43.48 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 171 aa  99.4  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  43.7 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  43.9 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  42.61 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  43.59 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  45.38 
 
 		 161 aa  98.6  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  44.07 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  47.01 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  45.38 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  43.22 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  41.74 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  44.54 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  42.74 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  46.96 
 
 		 180 aa  97.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  44.07 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  45.22 
 
 		 180 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  42.5 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  45.3 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  44.54 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  44.25 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  42.5 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  45.3 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  43.8 
 
 		 136 aa  95.9  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  42.15 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>