More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0816 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 140 aa  295  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  73.72 
 
 		 141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  72.26 
 
 		 141 aa  226  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  62.79 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  61.42 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  56.82 
 
 		 136 aa  163  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  58.7 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  63.41 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  55.3 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 		 138 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  53.96 
 
 		 137 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  60.16 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  61.48 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  61.48 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  60.66 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  54.68 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 133 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.4 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  57.72 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 183 aa  154  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  56.8 
 
 		 136 aa  153  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 		 128 aa  153  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  53.24 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  58.27 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  53.38 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  53.12 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  53.62 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 136 aa  150  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  55.47 
 
 		 134 aa  149  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  55.38 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  52.8 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  58.2 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  59.35 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  57.72 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  57.38 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  56.25 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  54.1 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  53.73 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  54.2 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  54.48 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  53.44 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  56.35 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  54.4 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  54.4 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  57.85 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  57.85 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>