More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1379 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
133 aa  278  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  77.44 
 
 
133 aa  216  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  77.86 
 
 
135 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  75.97 
 
 
141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  69.92 
 
 
133 aa  207  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  74.62 
 
 
140 aa  200  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  72.66 
 
 
147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  68.99 
 
 
136 aa  193  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  68.99 
 
 
149 aa  193  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  68.22 
 
 
136 aa  191  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  68.99 
 
 
136 aa  189  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  68.99 
 
 
136 aa  189  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  68.99 
 
 
136 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  67.44 
 
 
136 aa  188  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  68.99 
 
 
140 aa  185  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  67.97 
 
 
142 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  66.15 
 
 
133 aa  185  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  63.85 
 
 
144 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  66.14 
 
 
146 aa  179  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  63.08 
 
 
178 aa  178  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  67.2 
 
 
146 aa  176  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  64.52 
 
 
148 aa  175  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  63.64 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  60.31 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 
131 aa  168  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  63.36 
 
 
133 aa  168  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  62.9 
 
 
133 aa  167  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  63.41 
 
 
171 aa  167  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  58.46 
 
 
139 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  63.85 
 
 
148 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
141 aa  161  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 
131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  62.02 
 
 
136 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
138 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  61.24 
 
 
137 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 
153 aa  157  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  57.69 
 
 
137 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  58.91 
 
 
137 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 
142 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
133 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  56.92 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 
147 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  54.62 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  56.39 
 
 
131 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  56.92 
 
 
137 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 
135 aa  147  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 
135 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  55.64 
 
 
131 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 
136 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 
132 aa  146  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 
128 aa  146  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
159 aa  146  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
131 aa  146  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.27 
 
 
148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  55.91 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 
142 aa  144  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 
128 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 
128 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.03 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  51.91 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 
140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  54.2 
 
 
146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  55.3 
 
 
140 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  52.38 
 
 
136 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 
140 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  51.52 
 
 
134 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  55.3 
 
 
140 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  51.16 
 
 
145 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  54.14 
 
 
136 aa  141  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  53.44 
 
 
131 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 
140 aa  140  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 
142 aa  140  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  53.79 
 
 
150 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  51.88 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.88 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  50.39 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  51.88 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
183 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  52.63 
 
 
159 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  52.34 
 
 
136 aa  137  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 
131 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  53.03 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
180 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  48.44 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  50.76 
 
 
139 aa  136  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
171 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
151 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 
174 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
171 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 
171 aa  136  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 
140 aa  136  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  47.69 
 
 
130 aa  136  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  46.62 
 
 
131 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 
132 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>