More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0270 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
184 aa  387  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  60.22 
 
 
171 aa  223  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
171 aa  222  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  55.68 
 
 
180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  53.71 
 
 
506 aa  209  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  55.11 
 
 
177 aa  209  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  56.79 
 
 
190 aa  205  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 
150 aa  201  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  62.88 
 
 
154 aa  187  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  51.4 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  49.38 
 
 
183 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
159 aa  154  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 
142 aa  152  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  54.89 
 
 
137 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 
147 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 
145 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
185 aa  150  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 
140 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  59.02 
 
 
180 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 
132 aa  148  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  50.77 
 
 
134 aa  148  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
136 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 
130 aa  147  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 
138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 
142 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  52.03 
 
 
132 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  48.84 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  50.39 
 
 
138 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  51.94 
 
 
136 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 
128 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  53.91 
 
 
150 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  49.25 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  56.2 
 
 
128 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  54.69 
 
 
137 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  51.88 
 
 
137 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  51.52 
 
 
140 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  48.06 
 
 
136 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 
141 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
128 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  51.18 
 
 
135 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 
140 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  51.49 
 
 
136 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  54.07 
 
 
137 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  44.24 
 
 
148 aa  144  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 
133 aa  144  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 
137 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
133 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 
136 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
141 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  52.24 
 
 
136 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 
135 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
137 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  49.6 
 
 
142 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 
136 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  47.76 
 
 
148 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 
131 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  49.23 
 
 
155 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 
174 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  51.16 
 
 
136 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  52.42 
 
 
131 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
134 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 
140 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 
140 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 
140 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 
136 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
139 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 
177 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 
141 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  51.61 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  51.18 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  51.16 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
136 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 
131 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  47.29 
 
 
137 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  47.01 
 
 
149 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 
133 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  52.89 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
142 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  47.76 
 
 
137 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  48.51 
 
 
138 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  49.25 
 
 
136 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 
134 aa  138  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  48.51 
 
 
138 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  48.41 
 
 
133 aa  137  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  44.67 
 
 
152 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 
159 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
167 aa  137  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 
176 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 
131 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  52.03 
 
 
141 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  46.92 
 
 
161 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  44.93 
 
 
151 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  46.83 
 
 
134 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  51.18 
 
 
176 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 
176 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 
163 aa  135  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>