More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1589 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
149 aa  312  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  77.52 
 
 
136 aa  210  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  73.48 
 
 
136 aa  210  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  76.74 
 
 
136 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  76.74 
 
 
136 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  73.48 
 
 
136 aa  209  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  73.85 
 
 
133 aa  206  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  75 
 
 
136 aa  205  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  71.97 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  65.52 
 
 
147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  68.22 
 
 
148 aa  194  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  68.99 
 
 
133 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  71.43 
 
 
161 aa  191  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  68.99 
 
 
133 aa  191  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  72 
 
 
146 aa  190  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  65.19 
 
 
144 aa  189  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  69.53 
 
 
178 aa  189  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  70.54 
 
 
135 aa  188  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  66.42 
 
 
146 aa  185  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  67.46 
 
 
140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  69.11 
 
 
171 aa  178  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  62.41 
 
 
133 aa  174  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  64.18 
 
 
141 aa  173  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  65.12 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  63.64 
 
 
140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  62.41 
 
 
133 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 
131 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  64.84 
 
 
133 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  58.96 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  64.34 
 
 
133 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  62.2 
 
 
136 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  57.04 
 
 
153 aa  157  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 
147 aa  155  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 
148 aa  153  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  56.91 
 
 
141 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  54.55 
 
 
138 aa  150  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 
136 aa  150  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 
132 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  52.76 
 
 
134 aa  148  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  55.28 
 
 
141 aa  148  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
142 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  56.06 
 
 
142 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  53.9 
 
 
139 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  53.85 
 
 
131 aa  148  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  55.81 
 
 
134 aa  146  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  54.01 
 
 
137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  53.73 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  54.48 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
142 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  53.73 
 
 
137 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 
140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 
137 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  54.62 
 
 
135 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 
140 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
132 aa  141  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
131 aa  141  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 
137 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
138 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  51.37 
 
 
148 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 
128 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  51.49 
 
 
171 aa  140  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 
128 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  49.66 
 
 
176 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 
140 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 
136 aa  140  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  51.13 
 
 
171 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  47.01 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  51.47 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  51.47 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 
159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 
143 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.73 
 
 
135 aa  138  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  48.44 
 
 
133 aa  137  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  55.04 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 
136 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  50.74 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
142 aa  137  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  48.89 
 
 
141 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 
131 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
143 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 
146 aa  136  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  50.74 
 
 
143 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 
183 aa  136  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 
135 aa  135  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  53.44 
 
 
136 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
143 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 
131 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 
151 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 
131 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  51.13 
 
 
176 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  51.13 
 
 
176 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  52.52 
 
 
137 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  51.13 
 
 
176 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>