More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12453 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 131 aa  278  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  58.54 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  54.2 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 136 aa  159  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 		 137 aa  159  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 141 aa  157  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  58.54 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 138 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  54.62 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 		 136 aa  156  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 133 aa  156  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  54.4 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  58.06 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  56.49 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 166 aa  153  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 165 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 183 aa  153  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 165 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  55.2 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 153 aa  151  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  54.4 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  51.94 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 166 aa  151  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 		 128 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  51.2 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  51.97 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 165 aa  149  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 180 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 180 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  50.79 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 164 aa  149  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  53.17 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  52.67 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  52.94 
 
 		 136 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  53.17 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 174 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  47.69 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  53.23 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  49.62 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 134 aa  146  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  46.92 
 
 		 176 aa  146  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 198 aa  146  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 167 aa  146  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  52.8 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  53.23 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  48.41 
 
 		 167 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  51.13 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  45.74 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  53.28 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  52.07 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  50.39 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  48 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>