More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2824 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
147 aa  307  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  74.62 
 
 
133 aa  212  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  76.52 
 
 
135 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  74.44 
 
 
141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  71.11 
 
 
136 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  70.9 
 
 
136 aa  204  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  71.43 
 
 
136 aa  202  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  71.21 
 
 
133 aa  202  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  71.43 
 
 
136 aa  202  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  73.6 
 
 
136 aa  202  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  71.43 
 
 
136 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  65.52 
 
 
149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  71.65 
 
 
140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  72.66 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  70.23 
 
 
140 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  65.71 
 
 
146 aa  190  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  66.17 
 
 
142 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  63.12 
 
 
146 aa  188  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
161 aa  185  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  64.12 
 
 
144 aa  184  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  59.59 
 
 
178 aa  184  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
133 aa  183  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  63.36 
 
 
148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  64.84 
 
 
133 aa  176  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
136 aa  174  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  65.89 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  57.75 
 
 
171 aa  169  9e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  63.57 
 
 
141 aa  169  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 
131 aa  168  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 
133 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  60.47 
 
 
136 aa  163  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 
145 aa  163  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  62.99 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  57.04 
 
 
142 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
153 aa  153  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  58.46 
 
 
142 aa  153  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  55.97 
 
 
139 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 
131 aa  148  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 
137 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  51.43 
 
 
141 aa  147  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  49.24 
 
 
133 aa  146  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  55.12 
 
 
141 aa  146  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 
134 aa  143  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.38 
 
 
135 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  47.73 
 
 
134 aa  142  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 
147 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
138 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 
137 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  52.31 
 
 
134 aa  141  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.17 
 
 
148 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 
136 aa  140  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.62 
 
 
140 aa  140  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  51.82 
 
 
137 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  53.6 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  53.6 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  46.21 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  54.62 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  51.82 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  54.69 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
132 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  56.2 
 
 
140 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 
171 aa  136  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  57.85 
 
 
140 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 
137 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  57.85 
 
 
140 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  47.59 
 
 
151 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 
136 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  51.2 
 
 
141 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  56 
 
 
150 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  48.85 
 
 
138 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  52.31 
 
 
131 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
183 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 
134 aa  133  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
140 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  50.78 
 
 
140 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 
143 aa  133  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  53.54 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  48.48 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 
143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  46.53 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  48.8 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 
143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 
143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  50.4 
 
 
171 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 
151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  51.15 
 
 
138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  50.78 
 
 
131 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 
161 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>