More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2960 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 137 aa  289  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  86.13 
 
 		 137 aa  254  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  82.48 
 
 		 137 aa  246  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  79.56 
 
 		 137 aa  239  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  81.02 
 
 		 136 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  78.1 
 
 		 137 aa  236  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  80.43 
 
 		 138 aa  235  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  67.18 
 
 		 131 aa  193  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  64.06 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  61.65 
 
 		 183 aa  179  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  62.02 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  67.19 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  60.77 
 
 		 135 aa  176  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 190 aa  167  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  62.4 
 
 		 180 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  57.81 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  58.59 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  60.8 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  58.59 
 
 		 133 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  60.32 
 
 		 136 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  57.03 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  56.3 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 180 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 171 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 171 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  57.89 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  60.32 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  57.81 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  60.16 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  56.35 
 
 		 135 aa  157  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  59.06 
 
 		 165 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 163 aa  157  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  54.01 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.68 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  54.96 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 140 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  54.68 
 
 		 140 aa  157  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  56.06 
 
 		 189 aa  157  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  56.69 
 
 		 130 aa  156  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 140 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  58.4 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 171 aa  156  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 		 185 aa  156  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  56.06 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  57.94 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 137 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  54.07 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  53.28 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  54.74 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  53.66 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  56.92 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 		 128 aa  153  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  54.96 
 
 		 133 aa  153  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 161 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 		 161 aa  153  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 151 aa  153  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 		 134 aa  153  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 143 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  51.11 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  56.2 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  59.5 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 		 171 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  54.89 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  54.76 
 
 		 167 aa  151  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>