More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3073 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
155 aa  326  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  62.42 
 
 
167 aa  214  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  70.97 
 
 
174 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  60.38 
 
 
176 aa  188  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  59.33 
 
 
167 aa  187  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  60.96 
 
 
166 aa  187  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  62.76 
 
 
176 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  62.76 
 
 
176 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  62.76 
 
 
176 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  65.32 
 
 
190 aa  184  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
159 aa  183  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  58.67 
 
 
167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  66.93 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 
141 aa  180  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  58.67 
 
 
198 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  66.13 
 
 
167 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  64 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  64.52 
 
 
180 aa  177  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 
138 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 
138 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  66.94 
 
 
165 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
131 aa  177  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  62.99 
 
 
183 aa  177  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  65.6 
 
 
161 aa  176  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  65.6 
 
 
165 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  66.13 
 
 
138 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
136 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 
166 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  63.71 
 
 
180 aa  174  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  64.8 
 
 
165 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  56.13 
 
 
161 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  65.32 
 
 
152 aa  173  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  60.15 
 
 
137 aa  173  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 
138 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  60.8 
 
 
164 aa  172  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 
138 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  63.71 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  63.71 
 
 
171 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  58.44 
 
 
171 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  60.71 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  59.23 
 
 
135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  61.6 
 
 
167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  62.4 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  55.26 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  62.9 
 
 
166 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  66.13 
 
 
136 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  59.2 
 
 
132 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 
146 aa  168  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
137 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 
132 aa  167  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 
136 aa  166  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
137 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  52.98 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 
160 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
148 aa  164  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 
139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  51.63 
 
 
163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  56.82 
 
 
137 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  55.1 
 
 
161 aa  163  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 
154 aa  163  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 
137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  61.48 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 
133 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 
153 aa  161  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  57.72 
 
 
157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  56.15 
 
 
138 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  55.15 
 
 
189 aa  160  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
185 aa  159  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  60.98 
 
 
150 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  54.01 
 
 
137 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  59.68 
 
 
135 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  51.09 
 
 
138 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  60.47 
 
 
134 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
135 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 
169 aa  158  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  60.47 
 
 
134 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  60.98 
 
 
140 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 
136 aa  158  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  60.98 
 
 
140 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  54.07 
 
 
136 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  55.47 
 
 
134 aa  157  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  55.38 
 
 
137 aa  157  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  54.74 
 
 
137 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  47.22 
 
 
148 aa  157  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 
142 aa  156  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 
151 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  55.12 
 
 
136 aa  155  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 
140 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  54.76 
 
 
130 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 
133 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2822  methionine-R-sulfoxide reductase  50.36 
 
 
150 aa  155  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  55.04 
 
 
133 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 
140 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 
140 aa  154  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  53.12 
 
 
137 aa  153  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 
131 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
140 aa  153  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>