More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0857 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  100 
 
 		 148 aa  315  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  57.53 
 
 		 148 aa  207  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2822  methionine-R-sulfoxide reductase  58.22 
 
 		 150 aa  196  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4333  methionine-R-sulfoxide reductase  53.15 
 
 		 146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  47.22 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  57.98 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  53.33 
 
 		 137 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  53.44 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 159 aa  150  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 164 aa  150  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  50.78 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  50.83 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  48.12 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  53.28 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  51.91 
 
 		 174 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  48.89 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 183 aa  143  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  54.1 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  52.03 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 		 164 aa  141  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  52.5 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  50.4 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  51.91 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  52.5 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  52.85 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  54.17 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  54.33 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  50.75 
 
 		 148 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  47.01 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  49.59 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  52.07 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  52 
 
 		 138 aa  137  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  51.2 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  52.03 
 
 		 131 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  53.23 
 
 		 167 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 		 161 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  48.78 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  52.03 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  47.45 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  44.03 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  48.76 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  49.19 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  48.39 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  49.19 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  52.03 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  47.2 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  49.59 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  43.92 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  49.19 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 171 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 		 166 aa  133  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>