More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2451 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  100 
 
 		 137 aa  286  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  66.15 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  65.12 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  66.92 
 
 		 132 aa  183  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  65.62 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  62.88 
 
 		 136 aa  180  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  64.34 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  62.7 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  63.08 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  62.9 
 
 		 138 aa  173  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 		 131 aa  170  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  59.26 
 
 		 135 aa  169  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 		 132 aa  169  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  61.11 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  62.79 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  62.88 
 
 		 163 aa  168  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  61.24 
 
 		 131 aa  168  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 177 aa  166  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  63.93 
 
 		 183 aa  166  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  60.98 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  60.94 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 180 aa  164  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  58.73 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  61.11 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  60.32 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  58.2 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  60.66 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 180 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 		 159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 		 185 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  57.69 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  58.2 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  61.29 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  56.59 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  61.9 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 		 134 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  56.49 
 
 		 134 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  57.6 
 
 		 140 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 139 aa  156  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  58.54 
 
 		 140 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  56.49 
 
 		 136 aa  156  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  54.07 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  58.54 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  56.8 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  58.2 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  60.98 
 
 		 135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  57.72 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 155 aa  153  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 137 aa  153  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  56.06 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  60.16 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  53.44 
 
 		 136 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  57.6 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 155 aa  149  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  57.6 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  54.33 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  53.6 
 
 		 166 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  55.38 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  57.98 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2822  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  55.91 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  48.85 
 
 		 166 aa  148  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 167 aa  148  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  49.61 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 290 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 		 138 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  59.66 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  57.6 
 
 		 132 aa  146  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  52.76 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 206 aa  145  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>