More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1817 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
154 aa  325  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  62.91 
 
 
161 aa  193  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  62.84 
 
 
163 aa  188  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  57.25 
 
 
156 aa  177  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 
177 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  56.92 
 
 
135 aa  166  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  61.29 
 
 
138 aa  165  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  57.58 
 
 
133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  53.19 
 
 
180 aa  163  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 
131 aa  163  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  53.19 
 
 
180 aa  163  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 
183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  53.15 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  57.69 
 
 
137 aa  160  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  57.25 
 
 
136 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.79 
 
 
132 aa  159  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 
140 aa  158  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  51.52 
 
 
135 aa  156  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  65.52 
 
 
144 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  53.33 
 
 
150 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  54.69 
 
 
134 aa  153  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
140 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  54.2 
 
 
135 aa  152  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  54.48 
 
 
148 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
140 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 
136 aa  150  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 
132 aa  151  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 
137 aa  150  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 
142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 
171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 
134 aa  150  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 
167 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 
130 aa  148  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  51.16 
 
 
140 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 
131 aa  148  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 
137 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 
133 aa  147  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
151 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 
133 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
142 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  58.82 
 
 
160 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  55.65 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  57.38 
 
 
133 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  54.4 
 
 
167 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 
161 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 
136 aa  141  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 
132 aa  141  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  51.88 
 
 
135 aa  141  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 
136 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 
166 aa  140  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 
146 aa  140  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 
137 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  50.78 
 
 
131 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2822  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 
150 aa  140  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 
137 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  53.78 
 
 
127 aa  139  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  48.87 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  52.76 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  49.21 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  48.44 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 
155 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  53.28 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  55.08 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  49.18 
 
 
189 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  48.36 
 
 
136 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  49.22 
 
 
131 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 
142 aa  137  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  48.82 
 
 
131 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2558  methionine-R-sulfoxide reductase  48.48 
 
 
141 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0971304  normal  0.867883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2945  methionine-R-sulfoxide reductase  48.48 
 
 
141 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  48.82 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  48.09 
 
 
134 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 
142 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 
134 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 
159 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  48.8 
 
 
136 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  55.12 
 
 
134 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 
137 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 
133 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 
178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  44.74 
 
 
171 aa  134  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  48.51 
 
 
131 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 
154 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  53.28 
 
 
141 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 
134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.28 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4333  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>