More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2039 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
131 aa  275  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  70.87 
 
 
134 aa  197  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  63.78 
 
 
131 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  68.03 
 
 
137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  64.84 
 
 
133 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 
131 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  65.35 
 
 
131 aa  176  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  62.7 
 
 
148 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  61.72 
 
 
131 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  60.8 
 
 
140 aa  174  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  64.52 
 
 
183 aa  173  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  60.63 
 
 
133 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  64.52 
 
 
163 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  62.2 
 
 
131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 
166 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  65.87 
 
 
135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  60.94 
 
 
131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  63.49 
 
 
131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  63.2 
 
 
135 aa  169  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  61.72 
 
 
136 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 
132 aa  169  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  59.38 
 
 
142 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  60 
 
 
134 aa  168  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 
132 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  61.24 
 
 
137 aa  168  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 
132 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  59.84 
 
 
131 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 
133 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  61.11 
 
 
134 aa  163  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 
147 aa  163  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
177 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  60.48 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  62.7 
 
 
137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 
146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  62.6 
 
 
138 aa  161  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 
159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  60.98 
 
 
136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  60 
 
 
139 aa  160  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  58.59 
 
 
134 aa  160  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  56.49 
 
 
132 aa  159  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 
131 aa  159  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
142 aa  159  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 
133 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 
133 aa  158  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  61.11 
 
 
137 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 
151 aa  157  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 
135 aa  157  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 
139 aa  156  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  58.73 
 
 
137 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 
141 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 
133 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
140 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
130 aa  154  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
140 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
128 aa  153  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  54.92 
 
 
134 aa  153  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
128 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  58.4 
 
 
150 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 
185 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
137 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 
167 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  59.52 
 
 
133 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
159 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  61.24 
 
 
136 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  56.67 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 
134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 
128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  56.3 
 
 
137 aa  150  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  56.3 
 
 
137 aa  150  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  56.3 
 
 
137 aa  150  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  56.3 
 
 
137 aa  150  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 
135 aa  150  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  56.3 
 
 
137 aa  150  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  59.06 
 
 
137 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  56.3 
 
 
137 aa  150  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  56.3 
 
 
137 aa  150  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  56.3 
 
 
137 aa  150  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
136 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  56.15 
 
 
130 aa  150  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  56.45 
 
 
144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  55.83 
 
 
137 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 
141 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
137 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  55.47 
 
 
149 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 
140 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
137 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 
140 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
137 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
137 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 
154 aa  148  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  55.04 
 
 
134 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
137 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 
134 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  57.72 
 
 
161 aa  148  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>