More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1889 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
132 aa  279  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  67.97 
 
 
133 aa  193  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  65.38 
 
 
134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  66.94 
 
 
128 aa  186  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  66.13 
 
 
128 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  66.92 
 
 
137 aa  183  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  66.94 
 
 
128 aa  183  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  66.41 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  64.23 
 
 
136 aa  180  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  63.78 
 
 
140 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 
136 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  62.99 
 
 
140 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  65.04 
 
 
135 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  63.57 
 
 
159 aa  178  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  62.7 
 
 
137 aa  176  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  61.9 
 
 
137 aa  175  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  63.85 
 
 
146 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  64.57 
 
 
183 aa  174  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  62.79 
 
 
136 aa  172  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  64.29 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  63.49 
 
 
131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  61.48 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 
136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 
134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  63.78 
 
 
131 aa  169  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  59.38 
 
 
141 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  62.99 
 
 
131 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  63.64 
 
 
133 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  61.07 
 
 
136 aa  167  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 
155 aa  167  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 
137 aa  166  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  60 
 
 
138 aa  166  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 
141 aa  166  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  62.9 
 
 
163 aa  166  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  62.2 
 
 
131 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  62.99 
 
 
131 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  60.94 
 
 
130 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  59.06 
 
 
134 aa  164  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 
139 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 
131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  60.8 
 
 
135 aa  163  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  62.9 
 
 
141 aa  163  9e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  61.9 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
133 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  63.41 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 
131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  61.42 
 
 
131 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  62.1 
 
 
141 aa  161  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  58.59 
 
 
135 aa  161  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 
151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  61.83 
 
 
136 aa  160  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 
131 aa  159  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  58.27 
 
 
144 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  60.8 
 
 
143 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 
135 aa  159  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  59.52 
 
 
133 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  60.32 
 
 
137 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 
136 aa  158  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  60.15 
 
 
137 aa  158  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  59.52 
 
 
137 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 
177 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  58.73 
 
 
136 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  58.73 
 
 
137 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 
140 aa  158  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 
180 aa  157  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  59.52 
 
 
137 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
159 aa  157  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  59.2 
 
 
143 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 
143 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
154 aa  155  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  58.46 
 
 
140 aa  155  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 
167 aa  156  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2822  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 
150 aa  156  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 
131 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 
133 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 
143 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 
143 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  54.69 
 
 
133 aa  154  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 
143 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
135 aa  153  7e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 
143 aa  153  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  56.92 
 
 
149 aa  153  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
185 aa  153  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 
180 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 
148 aa  152  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  61.16 
 
 
135 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 
130 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  52.67 
 
 
134 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 
189 aa  151  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 
161 aa  150  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 
136 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
171 aa  150  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  57.14 
 
 
139 aa  149  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 
137 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 
137 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>