More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2936 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 136 aa  286  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  84.33 
 
 		 137 aa  239  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  81.62 
 
 		 136 aa  234  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  80.6 
 
 		 137 aa  233  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  80.6 
 
 		 137 aa  233  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  78.68 
 
 		 136 aa  228  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  76.87 
 
 		 137 aa  224  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  75.37 
 
 		 137 aa  223  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  62.12 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  61.36 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  59.85 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  63.16 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  59.85 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  62.02 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  61.24 
 
 		 128 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  62.02 
 
 		 128 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  59.85 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  59.23 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  60.47 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  56.06 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  56.06 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  57.58 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  61.83 
 
 		 132 aa  160  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 131 aa  159  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  55.88 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  56.59 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  56.62 
 
 		 135 aa  156  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  55.88 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  52.99 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  55.81 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  55.3 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  52.21 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  53.68 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  56.39 
 
 		 133 aa  150  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  56.06 
 
 		 135 aa  150  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  54.01 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  54.41 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  55.81 
 
 		 139 aa  147  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  57.36 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  56.39 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  51.91 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  56.14 
 
 		 131 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  53.03 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  53.68 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  53.68 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  52.21 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  52.21 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  55.81 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 143 aa  143  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  52.67 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 183 aa  143  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  51.11 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  54.55 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.63 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  52.63 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  50.74 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  56.3 
 
 		 135 aa  141  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  54.2 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  52.24 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  49.26 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  52.24 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  51.47 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  52.24 
 
 		 143 aa  139  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  54.89 
 
 		 140 aa  139  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  50.74 
 
 		 134 aa  139  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  51.85 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  51.52 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  51.49 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  51.13 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  49.64 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  49.63 
 
 		 177 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  47.79 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  51.52 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  55.17 
 
 		 137 aa  136  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  56.03 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  56.03 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  56.03 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  56.03 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>