More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2822 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2822  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 150 aa  318  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 148 aa  227  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  58.22 
 
 		 148 aa  196  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4333  methionine-R-sulfoxide reductase  56.46 
 
 		 146 aa  190  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 		 135 aa  167  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  61.79 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  50.36 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 		 167 aa  151  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 164 aa  150  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  53.78 
 
 		 127 aa  150  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  57.26 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  56.45 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  55.28 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  53.66 
 
 		 128 aa  147  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  53.66 
 
 		 128 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  53.23 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  50.74 
 
 		 180 aa  144  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  56.45 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  55 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  49.25 
 
 		 177 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 134 aa  140  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  54.47 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 206 aa  139  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  52.8 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  54.47 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  48.44 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  52.03 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  51.54 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 166 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 198 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  51.22 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  48.78 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  49.23 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  48.78 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 		 131 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 		 140 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  50.79 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  50 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  50.41 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  52.03 
 
 		 167 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  51.16 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  48.36 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  50.4 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  50.79 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  46.62 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>