More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1777 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
166 aa  347  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  66.87 
 
 
164 aa  244  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  70.2 
 
 
152 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  63.19 
 
 
164 aa  230  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  73.48 
 
 
138 aa  219  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  73.48 
 
 
138 aa  219  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  59.01 
 
 
167 aa  214  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  56.02 
 
 
169 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  60.12 
 
 
158 aa  207  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
166 aa  204  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  56.36 
 
 
167 aa  203  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  57.83 
 
 
190 aa  200  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  55.15 
 
 
167 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  63.7 
 
 
165 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  55.42 
 
 
198 aa  197  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  51.19 
 
 
174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  61.03 
 
 
165 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  52.41 
 
 
166 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 
171 aa  191  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  60.29 
 
 
165 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  64.06 
 
 
137 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
176 aa  187  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  59.7 
 
 
174 aa  187  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  51.48 
 
 
171 aa  187  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  52.26 
 
 
161 aa  187  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  53.33 
 
 
161 aa  186  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  60.74 
 
 
176 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  60.74 
 
 
176 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  60.74 
 
 
176 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  53.25 
 
 
164 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  62.7 
 
 
137 aa  184  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  55.76 
 
 
160 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  52.12 
 
 
167 aa  184  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  64.23 
 
 
161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  63.49 
 
 
138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  54.55 
 
 
164 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  60.94 
 
 
171 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  53.9 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  53.15 
 
 
151 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  64.52 
 
 
168 aa  180  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
180 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  64.23 
 
 
138 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  64.23 
 
 
138 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 
180 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  54.55 
 
 
163 aa  179  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  57.35 
 
 
171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  53.29 
 
 
167 aa  176  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  58.21 
 
 
136 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  51.48 
 
 
168 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  50.62 
 
 
161 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 
155 aa  175  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  48.77 
 
 
164 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  49.7 
 
 
168 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  61.16 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 
183 aa  170  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  55.48 
 
 
156 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 
136 aa  167  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  46.63 
 
 
157 aa  167  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  53.33 
 
 
168 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  54.48 
 
 
135 aa  167  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  59.26 
 
 
155 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 
142 aa  166  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  54.14 
 
 
136 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  58.52 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  52.41 
 
 
146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 
164 aa  160  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 
159 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.79 
 
 
135 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  53.97 
 
 
157 aa  157  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  53.49 
 
 
134 aa  156  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  58.26 
 
 
127 aa  156  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
202 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 
131 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  49.26 
 
 
148 aa  155  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  52.21 
 
 
138 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  57.5 
 
 
229 aa  154  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 
151 aa  154  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  52.9 
 
 
139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  52.67 
 
 
153 aa  154  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
131 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
131 aa  153  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 
131 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 
185 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
154 aa  151  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  47.79 
 
 
141 aa  150  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 
177 aa  150  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.52 
 
 
148 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 
140 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 
133 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  53.6 
 
 
137 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  52.27 
 
 
134 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 
134 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 
131 aa  148  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  50.78 
 
 
148 aa  148  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 
131 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 
133 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  48.89 
 
 
137 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  51.02 
 
 
163 aa  147  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>