More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1855 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 136 aa  286  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  83.94 
 
 		 137 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  83.94 
 
 		 137 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  81.88 
 
 		 138 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  81.02 
 
 		 137 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  81.02 
 
 		 137 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  80.29 
 
 		 137 aa  236  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  62.12 
 
 		 159 aa  186  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  66.15 
 
 		 131 aa  186  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  60.15 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  64.34 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  59.56 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  62.4 
 
 		 132 aa  170  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  58.02 
 
 		 148 aa  169  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  60.94 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  59.69 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  59.84 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 132 aa  167  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 131 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 131 aa  166  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  55.15 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  59.84 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 180 aa  164  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  61.6 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  58.46 
 
 		 134 aa  164  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 136 aa  163  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  59.38 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  59.06 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 		 165 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  56.92 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  58.14 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  56.92 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  59.68 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 190 aa  159  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  56.3 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  58.73 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  57.81 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  56.59 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  59.06 
 
 		 165 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  54.07 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  59.68 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  54.81 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  53.33 
 
 		 136 aa  157  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 185 aa  157  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  55.22 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  55.22 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  52.59 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  55.88 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  59.84 
 
 		 141 aa  156  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  53.03 
 
 		 141 aa  156  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  54.26 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  53.33 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  55.73 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  55.12 
 
 		 135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  51.11 
 
 		 146 aa  154  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  153  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 134 aa  153  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 131 aa  153  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>