More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2786 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  100 
 
 
134 aa  284  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  64.89 
 
 
159 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  65.38 
 
 
132 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  62.69 
 
 
136 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  64.34 
 
 
131 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
136 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  63.08 
 
 
131 aa  184  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  62.02 
 
 
140 aa  184  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  61.36 
 
 
132 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  64.34 
 
 
137 aa  179  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  62.31 
 
 
131 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 
131 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  60 
 
 
135 aa  177  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 
131 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
133 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  60.63 
 
 
138 aa  177  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 
132 aa  177  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  60.47 
 
 
135 aa  176  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  62.02 
 
 
132 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 
137 aa  176  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 
154 aa  176  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  62.02 
 
 
132 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
185 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  58.91 
 
 
131 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
131 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  60.47 
 
 
133 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  59.06 
 
 
137 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
131 aa  174  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  59.26 
 
 
139 aa  174  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  61.24 
 
 
133 aa  173  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  57.58 
 
 
136 aa  173  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 
133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  61.72 
 
 
130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  56.15 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  60.31 
 
 
131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  58.46 
 
 
146 aa  171  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
133 aa  170  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  59.54 
 
 
137 aa  170  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 
159 aa  170  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 
183 aa  171  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  56.06 
 
 
177 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  61.83 
 
 
163 aa  170  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
135 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
135 aa  168  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
131 aa  168  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
180 aa  167  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 
151 aa  167  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
180 aa  167  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 
134 aa  167  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  57.89 
 
 
133 aa  166  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  58.4 
 
 
141 aa  166  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  56.82 
 
 
136 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  60.94 
 
 
137 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 
141 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 
128 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 
128 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  54.96 
 
 
133 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  57.81 
 
 
137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 
128 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  58.46 
 
 
136 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  56.15 
 
 
140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  55.38 
 
 
140 aa  163  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  58.59 
 
 
137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 
135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  56.49 
 
 
137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  58.59 
 
 
134 aa  161  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  56.59 
 
 
144 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 
134 aa  161  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 
134 aa  161  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  55.38 
 
 
136 aa  161  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 
138 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
178 aa  160  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 
150 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 
138 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  62.18 
 
 
161 aa  159  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
137 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  59.38 
 
 
140 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 
189 aa  159  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 
131 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  51.16 
 
 
171 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  56.06 
 
 
133 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 
166 aa  157  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 
155 aa  157  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 
136 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 
161 aa  157  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  55.97 
 
 
135 aa  157  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 
140 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 
140 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  53.68 
 
 
136 aa  156  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 
137 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 
147 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  54.69 
 
 
139 aa  154  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
156 aa  154  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  52.21 
 
 
136 aa  154  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
133 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 
137 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 
131 aa  154  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  54.69 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>