More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1584 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 147 aa  310  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  70.92 
 
 		 166 aa  223  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  78.12 
 
 		 136 aa  223  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  73.17 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  66.37 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  60.16 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  65.52 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  61.74 
 
 		 131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  64.6 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  59.66 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  59.66 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  58.82 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  63.79 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  58.82 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  55.83 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  53.54 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  56.56 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  56.56 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  56.56 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  54.33 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 		 131 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 136 aa  150  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  49.22 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  52.8 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 134 aa  146  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  50.4 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 167 aa  145  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  51.16 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  53.72 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  52.14 
 
 		 142 aa  143  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  45.59 
 
 		 140 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  47.33 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  51.09 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 136 aa  141  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  48.78 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  49.21 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 177 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 		 132 aa  141  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  51.61 
 
 		 135 aa  140  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  48.8 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  47.24 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  53.28 
 
 		 183 aa  140  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 133 aa  140  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  48.85 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 133 aa  140  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  49.17 
 
 		 141 aa  139  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  48.82 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  44.88 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  46.46 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  46.27 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  48.03 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>