More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1286 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 141 aa  296  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  78.03 
 
 		 137 aa  227  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  80.49 
 
 		 137 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  67.2 
 
 		 159 aa  190  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  60.77 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  59.42 
 
 		 146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  63.11 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  66.13 
 
 		 135 aa  180  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 		 155 aa  180  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  65.04 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  60.32 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 167 aa  176  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  62.6 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 167 aa  173  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  61.6 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  65.85 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 		 131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  58.4 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  62.12 
 
 		 198 aa  169  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  61.72 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  63.41 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  58.2 
 
 		 128 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 		 132 aa  166  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  58.4 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  59.35 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  58.4 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  54.14 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  55.07 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  58.2 
 
 		 128 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  54.96 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  55.86 
 
 		 166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  55.07 
 
 		 165 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  55.64 
 
 		 137 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  60.66 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  60.83 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  54.29 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  54.74 
 
 		 165 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  63.03 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  63.79 
 
 		 135 aa  160  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 164 aa  158  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  62.18 
 
 		 140 aa  157  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 		 166 aa  157  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  54.4 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  61.34 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  57.02 
 
 		 144 aa  157  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.04 
 
 		 137 aa  156  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  54.96 
 
 		 164 aa  156  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 		 190 aa  156  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  53.03 
 
 		 136 aa  156  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  57.98 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  54.47 
 
 		 134 aa  155  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  59.5 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  55.3 
 
 		 163 aa  155  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  54.07 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  54.84 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  56.8 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  57.98 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 137 aa  153  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 136 aa  153  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  52.63 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 180 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  52.11 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  52.11 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  53.03 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  52.11 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  54.26 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  52.11 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  52.11 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  54.47 
 
 		 180 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  54.92 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  56.92 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  51.59 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  47.79 
 
 		 166 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  51.41 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  56 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>