More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3669 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
133 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  64.12 
 
 
135 aa  176  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  63.28 
 
 
133 aa  174  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  62.12 
 
 
133 aa  174  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  64.12 
 
 
133 aa  174  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  61.83 
 
 
161 aa  174  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  64.06 
 
 
140 aa  173  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  61.83 
 
 
146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  61.07 
 
 
178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  62.41 
 
 
149 aa  169  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  63.28 
 
 
146 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 
147 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  63.36 
 
 
141 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  63.36 
 
 
133 aa  168  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  63.71 
 
 
131 aa  168  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 
144 aa  167  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  60.47 
 
 
139 aa  166  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  62.6 
 
 
136 aa  166  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 
136 aa  166  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 
136 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  60.47 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
136 aa  164  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  60.45 
 
 
136 aa  164  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  59.54 
 
 
133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  58.09 
 
 
136 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  57.36 
 
 
138 aa  158  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  57.69 
 
 
131 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 
148 aa  158  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 
142 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  59.35 
 
 
171 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  55.73 
 
 
148 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 
137 aa  157  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  58.02 
 
 
140 aa  157  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  57.89 
 
 
132 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 
159 aa  156  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 
141 aa  156  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
131 aa  156  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 
147 aa  156  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  58.91 
 
 
138 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  57.94 
 
 
141 aa  155  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
131 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 
137 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
140 aa  155  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  60.16 
 
 
141 aa  156  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  52.63 
 
 
133 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  58.91 
 
 
136 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  57.69 
 
 
136 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  55.3 
 
 
145 aa  154  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
142 aa  154  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  57.14 
 
 
134 aa  154  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  57.6 
 
 
143 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 
143 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  57.14 
 
 
135 aa  154  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  54.62 
 
 
131 aa  153  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  57.6 
 
 
143 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 
142 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  56.82 
 
 
137 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 
143 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 
143 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 
131 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 
143 aa  151  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 
142 aa  152  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  54.62 
 
 
131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  55.38 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  56.49 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  56.59 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  55.97 
 
 
136 aa  150  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  56.49 
 
 
140 aa  150  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 
132 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  56.59 
 
 
137 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 
137 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  57.6 
 
 
136 aa  149  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 
143 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 
131 aa  150  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 
131 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 
141 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 
132 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 
131 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 
159 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 
151 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  58.4 
 
 
128 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  58.4 
 
 
128 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
133 aa  148  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  55.38 
 
 
134 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 
137 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  51.88 
 
 
135 aa  147  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
142 aa  148  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 
136 aa  147  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  53.03 
 
 
153 aa  148  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 
133 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  52.31 
 
 
140 aa  147  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
143 aa  147  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 
135 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 
134 aa  147  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  55.3 
 
 
137 aa  146  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>