More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1873 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 131 aa  275  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  99.24 
 
 		 131 aa  273  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  97.71 
 
 		 131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  87.02 
 
 		 133 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  80.92 
 
 		 131 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  80 
 
 		 131 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  76.34 
 
 		 131 aa  228  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  62.6 
 
 		 133 aa  185  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  61.07 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  59.69 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  60.31 
 
 		 132 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  59.54 
 
 		 132 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  61.54 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  62.79 
 
 		 133 aa  176  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  60.47 
 
 		 135 aa  176  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  58.46 
 
 		 148 aa  176  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  61.54 
 
 		 159 aa  174  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 		 131 aa  174  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 		 133 aa  173  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  60.31 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 		 131 aa  170  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  60.47 
 
 		 131 aa  169  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 		 137 aa  169  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  60.31 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  62.3 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  60.31 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  62.99 
 
 		 132 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  60.16 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  57.36 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  58.73 
 
 		 140 aa  167  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  55.81 
 
 		 138 aa  166  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  58.91 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  59.68 
 
 		 128 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 189 aa  164  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 136 aa  164  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  55.64 
 
 		 136 aa  164  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  57.36 
 
 		 130 aa  163  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 		 132 aa  163  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  58.02 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  57.6 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 134 aa  161  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 141 aa  161  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  56.06 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  62.07 
 
 		 135 aa  160  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 		 134 aa  160  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 		 137 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 136 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  54.14 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  61.48 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 167 aa  157  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  54.84 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 183 aa  157  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 		 147 aa  157  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 		 137 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  53.91 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  53.91 
 
 		 144 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  55.12 
 
 		 135 aa  155  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 128 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  54.14 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  57.25 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 136 aa  153  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.91 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  55.12 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  59.38 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 177 aa  150  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  59.35 
 
 		 141 aa  151  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  55.04 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  52.27 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 167 aa  150  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  58.12 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  59.84 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>