More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6049 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 171 aa  362  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  66.08 
 
 		 171 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 		 506 aa  223  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  58.48 
 
 		 180 aa  220  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  58.48 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  65.07 
 
 		 150 aa  209  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  60.14 
 
 		 190 aa  204  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  63.01 
 
 		 154 aa  201  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  54.32 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  50.7 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  56.69 
 
 		 136 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  51.16 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  46.15 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  56.56 
 
 		 159 aa  154  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 		 132 aa  154  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 136 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  51.59 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 133 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 		 140 aa  151  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 		 154 aa  150  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  49.28 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 133 aa  150  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 		 132 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  54.76 
 
 		 135 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  53.23 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  48.55 
 
 		 140 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 		 142 aa  148  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 		 133 aa  148  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 		 137 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 		 137 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  51.13 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 		 141 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  50.81 
 
 		 144 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  50.78 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  50.82 
 
 		 135 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  47.97 
 
 		 134 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  46.48 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  50.4 
 
 		 127 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  52.94 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 136 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 146 aa  144  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 133 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  47.24 
 
 		 177 aa  144  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  52.07 
 
 		 185 aa  143  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  51.13 
 
 		 137 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  51.97 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 136 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  53.6 
 
 		 133 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  51.67 
 
 		 133 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 131 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  48.87 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  51.18 
 
 		 133 aa  141  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 136 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  49.6 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 		 140 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 141 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  50.78 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  50.41 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  50.4 
 
 		 133 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  48.51 
 
 		 138 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  48.12 
 
 		 137 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  48.51 
 
 		 138 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 		 155 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  51.13 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 136 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 		 135 aa  139  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  49.21 
 
 		 131 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  49.23 
 
 		 133 aa  138  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>