More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12689 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  285  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  82.84 
 
 
136 aa  243  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  82.84 
 
 
136 aa  243  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  82.84 
 
 
136 aa  243  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  84.96 
 
 
136 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  84.96 
 
 
136 aa  241  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  73.85 
 
 
141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  75.19 
 
 
133 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  73.44 
 
 
146 aa  206  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  72.52 
 
 
146 aa  206  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  75 
 
 
149 aa  205  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  73.6 
 
 
147 aa  202  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  70.77 
 
 
135 aa  196  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  69.47 
 
 
142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  68.99 
 
 
133 aa  193  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  69.23 
 
 
133 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
161 aa  192  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  69.35 
 
 
171 aa  187  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  63.7 
 
 
140 aa  187  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  64.84 
 
 
140 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  62.4 
 
 
144 aa  176  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  62.79 
 
 
148 aa  174  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 
133 aa  167  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  64.84 
 
 
133 aa  165  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  60.47 
 
 
148 aa  160  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  60.29 
 
 
141 aa  160  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 
133 aa  159  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 
136 aa  158  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 
131 aa  157  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 
136 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 
133 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  54.96 
 
 
142 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
142 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 
136 aa  151  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  54.07 
 
 
145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  51.52 
 
 
134 aa  149  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
142 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 
153 aa  148  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 
159 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  55.04 
 
 
131 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  56.69 
 
 
136 aa  146  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 
184 aa  146  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  49.62 
 
 
133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  54.62 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
140 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 
147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  54.26 
 
 
134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  54.2 
 
 
131 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 
134 aa  144  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
171 aa  143  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  52 
 
 
141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  53.08 
 
 
138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
140 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 
133 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 
127 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
132 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 
133 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 
148 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 
133 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  50.4 
 
 
141 aa  141  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
131 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 
132 aa  140  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 
139 aa  139  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 
171 aa  139  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  51.94 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  51.94 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  48.87 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  49.23 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 
131 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
140 aa  137  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 
180 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  55.81 
 
 
150 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
140 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  52.85 
 
 
135 aa  136  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 
180 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 
132 aa  135  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 
132 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  47.37 
 
 
137 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
189 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  48.8 
 
 
154 aa  135  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
140 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 
137 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
136 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  48.87 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 
180 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>