More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51697 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  100 
 
 
133 aa  281  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  55.12 
 
 
134 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  51.13 
 
 
140 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  48.87 
 
 
146 aa  147  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  49.24 
 
 
147 aa  146  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  51.16 
 
 
133 aa  147  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  49.62 
 
 
136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  49.24 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  47.01 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
136 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  52 
 
 
136 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
136 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01932  methionine-R-sulfoxide reductase SelR, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07840)  47.92 
 
 
153 aa  142  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 
161 aa  141  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
136 aa  141  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  51.52 
 
 
133 aa  139  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  48.8 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  47.69 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  48.44 
 
 
178 aa  138  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  48.44 
 
 
149 aa  137  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  48.44 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 
133 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
142 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 
148 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  49.6 
 
 
171 aa  133  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  45.31 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  44.36 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  45.74 
 
 
136 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  43.75 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  45.45 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  46.09 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  44.7 
 
 
137 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  48.8 
 
 
134 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  45.11 
 
 
131 aa  123  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  43.75 
 
 
133 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  47.2 
 
 
141 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  46.09 
 
 
135 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  49.23 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  42.97 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9083  predicted protein  46.83 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  46.09 
 
 
136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  43.41 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  46.92 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  40.46 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  41.41 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  46.88 
 
 
137 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  44.96 
 
 
133 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  43.75 
 
 
131 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  42.97 
 
 
145 aa  117  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  44.19 
 
 
159 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  44.88 
 
 
138 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  44.8 
 
 
171 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  44.88 
 
 
138 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  43.75 
 
 
131 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  44.53 
 
 
131 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  42.52 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  44.96 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  46.46 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  47.73 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  44.53 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  45.38 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  46.97 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  42.19 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  43.28 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  45.74 
 
 
138 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  45.38 
 
 
140 aa  114  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  42.52 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  42.52 
 
 
198 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2342  methionine-R-sulfoxide reductase  44.8 
 
 
125 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  47.24 
 
 
132 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  43.75 
 
 
167 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  41.41 
 
 
131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  43.75 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  42.75 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  40.44 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  44.27 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  42.97 
 
 
128 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  41.67 
 
 
142 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  40.15 
 
 
165 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  43.31 
 
 
134 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  41.6 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  44 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  42.42 
 
 
133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  43.41 
 
 
127 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  45.16 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  41.73 
 
 
153 aa  110  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  42.19 
 
 
128 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  40.94 
 
 
161 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  42.42 
 
 
166 aa  110  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  43.18 
 
 
136 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  40.94 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  44.44 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  39.37 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.79 
 
 
301 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  38.76 
 
 
134 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>