More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1317 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 134 aa  276  9e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  63.64 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  66.13 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  60.15 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  56.8 
 
 		 132 aa  157  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  59.02 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  54.07 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  57.26 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  54.92 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  60.5 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  55.64 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 135 aa  146  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  59.35 
 
 		 140 aa  146  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  50.37 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  56.91 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  57.38 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  56.56 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  57.38 
 
 		 131 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  54.17 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  48.78 
 
 		 137 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 137 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  54.92 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  51.2 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  57.38 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 177 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  57.5 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  54.92 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  50.75 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  54.76 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  51.13 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  48.82 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  54.1 
 
 		 185 aa  141  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  48.82 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  48.03 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  48.03 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  48.03 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  50.4 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  48.03 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  46.21 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  48.03 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2342  methionine-R-sulfoxide reductase  47.58 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 		 140 aa  140  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  51.85 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 133 aa  140  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  51.97 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  48.82 
 
 		 144 aa  140  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 136 aa  140  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 		 140 aa  139  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  53.23 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  51.97 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  54.4 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  50.82 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  53.6 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  49.25 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>