More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2689 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  86.99 
 
 		 147 aa  229  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  63.64 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  66.17 
 
 		 137 aa  177  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  65.08 
 
 		 136 aa  173  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 		 131 aa  170  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  58.78 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  59.12 
 
 		 183 aa  167  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  58.39 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 131 aa  164  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  60.8 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  58.73 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  58.73 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  58.45 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  56.34 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  57.94 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  59.35 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  60.74 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  59.52 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  60.66 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  57.72 
 
 		 136 aa  157  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  61.48 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  59.06 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  50.35 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  53.73 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 		 146 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  59.2 
 
 		 139 aa  156  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 140 aa  156  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 		 136 aa  156  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  55.22 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  56.8 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  60.33 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  56.8 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  54.35 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  57.04 
 
 		 147 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  58.4 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 159 aa  154  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  54.1 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  57.6 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  53.91 
 
 		 135 aa  153  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 184 aa  152  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  58.2 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  56.1 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  53.6 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  56.91 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  53.54 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 171 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  54.2 
 
 		 176 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  59.35 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  53.03 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 		 133 aa  150  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  59.35 
 
 		 136 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  59.35 
 
 		 136 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  54.55 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  58.54 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  56.1 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 163 aa  148  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  58.27 
 
 		 136 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 198 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  58.27 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 171 aa  147  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  53.96 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  55.81 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  53.66 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  59.17 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 180 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 		 137 aa  146  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  53.19 
 
 		 163 aa  146  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  54.7 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  47.79 
 
 		 164 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  54.2 
 
 		 180 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>