More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1895 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  82.54 
 
 
146 aa  231  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  77.69 
 
 
136 aa  214  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  75.19 
 
 
136 aa  213  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  75.38 
 
 
136 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  75.38 
 
 
136 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  75.38 
 
 
136 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  72.52 
 
 
136 aa  206  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  72.73 
 
 
141 aa  204  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  72.66 
 
 
142 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  73.6 
 
 
133 aa  195  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  64.38 
 
 
171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  63.04 
 
 
178 aa  190  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  63.12 
 
 
147 aa  188  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  66.92 
 
 
135 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  62.32 
 
 
161 aa  187  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  69.29 
 
 
133 aa  186  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  66.42 
 
 
149 aa  185  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  67.18 
 
 
140 aa  184  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  60.56 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  66.14 
 
 
133 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 
144 aa  173  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  61.83 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  65.12 
 
 
136 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 
153 aa  170  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 
140 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  64.06 
 
 
148 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 
133 aa  163  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  58.7 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  64 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 
133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  62.02 
 
 
133 aa  159  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 
131 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  55.81 
 
 
141 aa  158  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 
136 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  51.75 
 
 
140 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 
142 aa  157  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  52.45 
 
 
140 aa  156  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  54.68 
 
 
147 aa  154  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  53.17 
 
 
141 aa  151  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  55.38 
 
 
131 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  51.47 
 
 
137 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  54.96 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 
145 aa  149  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  56.69 
 
 
134 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.73 
 
 
137 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 
159 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
128 aa  147  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  51.09 
 
 
141 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
128 aa  147  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  48.87 
 
 
133 aa  147  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  48.95 
 
 
151 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  55.97 
 
 
138 aa  147  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 
131 aa  147  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 
128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  54.2 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 
137 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  50.78 
 
 
137 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  52.17 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  50.39 
 
 
134 aa  144  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 
143 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 
143 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 
151 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 
148 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  52.31 
 
 
133 aa  142  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 
143 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
161 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  51.56 
 
 
136 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.13 
 
 
142 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
189 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
151 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  51.45 
 
 
143 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
132 aa  141  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
143 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 
133 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  51.45 
 
 
143 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  50.72 
 
 
143 aa  140  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 
143 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 
131 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  52.31 
 
 
135 aa  140  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  54.4 
 
 
137 aa  139  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 
140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  50.77 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  49.29 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 
142 aa  137  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 
131 aa  136  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 
143 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
171 aa  137  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>