More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7118 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 171 aa  361  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  66.08 
 
 		 171 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  60.22 
 
 		 184 aa  223  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  56.07 
 
 		 177 aa  207  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  61.64 
 
 		 506 aa  206  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  55.49 
 
 		 180 aa  203  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  56.96 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  64.03 
 
 		 150 aa  194  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  62.04 
 
 		 154 aa  183  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  57.45 
 
 		 189 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  56.39 
 
 		 137 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 138 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  55.47 
 
 		 136 aa  151  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  53.38 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 142 aa  150  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  51.13 
 
 		 137 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 142 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  54.48 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  51.54 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  52.24 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  51.88 
 
 		 137 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 134 aa  147  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.54 
 
 		 135 aa  145  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  56.67 
 
 		 131 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  47.66 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  52.71 
 
 		 136 aa  143  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  47.83 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  51.18 
 
 		 138 aa  143  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  53.66 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  56.67 
 
 		 131 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  48.51 
 
 		 139 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 131 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  47.1 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 145 aa  141  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 136 aa  141  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  47.66 
 
 		 177 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  51.49 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  48.78 
 
 		 134 aa  140  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  50.42 
 
 		 133 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 133 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  49.22 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  55.83 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 131 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  53.49 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  49.61 
 
 		 135 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  51.16 
 
 		 133 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 131 aa  137  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  48.76 
 
 		 128 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  53.15 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  53.15 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 146 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  53.15 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  48.39 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  48.39 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  47.33 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  50.41 
 
 		 128 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  50.41 
 
 		 128 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  52.54 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  46.56 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  51.26 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  45.65 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 		 133 aa  136  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  48.09 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  48.8 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  48.8 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  48.8 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  48.8 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  48.8 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  50.81 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  53.33 
 
 		 131 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  46.46 
 
 		 132 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  51.26 
 
 		 131 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  46.4 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  51.52 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  44.74 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  46.76 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  50.42 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>