More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2240 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 145 aa  304  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  66.17 
 
 		 133 aa  188  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  67.2 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  66.18 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  65.35 
 
 		 133 aa  179  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 		 140 aa  167  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  58.96 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 136 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.73 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  55.3 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  55.22 
 
 		 148 aa  155  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  54.89 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  53.68 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  53.68 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  53.68 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  56.8 
 
 		 135 aa  153  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  54.89 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 184 aa  151  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  56.39 
 
 		 174 aa  150  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  54.07 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  54.69 
 
 		 133 aa  150  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  54.4 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  53.68 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  55.22 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  54.2 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  53.57 
 
 		 178 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  52.34 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 		 166 aa  146  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 136 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  55.91 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  51.15 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  53.33 
 
 		 165 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  55.04 
 
 		 176 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  53.03 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 176 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  55.04 
 
 		 176 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  54.4 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 176 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  52.86 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  52.94 
 
 		 136 aa  143  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 		 137 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  51.18 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 171 aa  141  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 171 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  51.16 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 160 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  53.91 
 
 		 151 aa  140  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  54.41 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 190 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  51.16 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  53.28 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  52.67 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  53.72 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  51.18 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  52.31 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  48.51 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  48.82 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  51.97 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  48.82 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>