More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0016 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
167 aa  348  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  84.43 
 
 
168 aa  301  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  68.12 
 
 
168 aa  238  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  72.46 
 
 
168 aa  234  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  63.52 
 
 
164 aa  233  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  63.52 
 
 
164 aa  231  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  62.89 
 
 
164 aa  230  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  61.78 
 
 
164 aa  227  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 
155 aa  204  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  61.84 
 
 
155 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  60.87 
 
 
164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  61.15 
 
 
158 aa  191  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  63.83 
 
 
161 aa  191  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  52.17 
 
 
202 aa  186  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  57.23 
 
 
198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  52.5 
 
 
161 aa  181  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  67.5 
 
 
167 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 
166 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  55.92 
 
 
168 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  61.59 
 
 
176 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  61.59 
 
 
176 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  61.59 
 
 
176 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  56.88 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  58.11 
 
 
165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  54.09 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  61.19 
 
 
167 aa  177  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  57.82 
 
 
165 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
171 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  52.44 
 
 
166 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  54.43 
 
 
161 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
171 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  63.71 
 
 
176 aa  175  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  53.61 
 
 
167 aa  174  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  56.46 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  61.31 
 
 
171 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  61.16 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  62.81 
 
 
164 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  50.6 
 
 
171 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  64.71 
 
 
174 aa  170  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  52.12 
 
 
169 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 
138 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 
138 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 
137 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  47.85 
 
 
164 aa  167  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  63.87 
 
 
174 aa  167  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  50.9 
 
 
167 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 
137 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  62.18 
 
 
190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  50.62 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  49.69 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0879  methionine-R-sulfoxide reductase  61.34 
 
 
135 aa  163  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  61.98 
 
 
138 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  57.72 
 
 
130 aa  160  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  63.03 
 
 
157 aa  160  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 
152 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  60.83 
 
 
138 aa  158  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  60.83 
 
 
138 aa  158  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  53.16 
 
 
163 aa  158  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  59.32 
 
 
151 aa  157  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  59.17 
 
 
136 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 
229 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
155 aa  148  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 
154 aa  147  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  49.64 
 
 
148 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  56.3 
 
 
135 aa  144  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  60.95 
 
 
156 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  57.63 
 
 
183 aa  143  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  56.2 
 
 
148 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  57.5 
 
 
159 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  48.15 
 
 
153 aa  141  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  56.9 
 
 
131 aa  141  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  45.75 
 
 
167 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 
127 aa  141  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  54.92 
 
 
136 aa  140  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.6 
 
 
135 aa  140  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
137 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  53.6 
 
 
133 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  49.61 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  53.38 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 
180 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  49.26 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  55.08 
 
 
180 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 
140 aa  138  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  53.72 
 
 
145 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  54.1 
 
 
131 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  51.26 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  53.78 
 
 
185 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 
133 aa  137  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  54.17 
 
 
137 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  53.23 
 
 
138 aa  137  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  42.69 
 
 
189 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
142 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
136 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  51.69 
 
 
132 aa  136  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  52.07 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  51.69 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  52.89 
 
 
139 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  53.39 
 
 
142 aa  134  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  50.4 
 
 
131 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  51.24 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>