More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12448 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  100 
 
 		 148 aa  309  6.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  54.74 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  53.57 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  54.14 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  58.06 
 
 		 161 aa  156  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  52.14 
 
 		 165 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 		 202 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  49.26 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 183 aa  154  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 164 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  50.71 
 
 		 165 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  50.71 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  49.65 
 
 		 176 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 174 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  48.25 
 
 		 171 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  53.03 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  51.16 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  49.64 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  44.24 
 
 		 184 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  52.14 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  59.17 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  54.81 
 
 		 164 aa  143  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  48.44 
 
 		 190 aa  143  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  56.2 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  48.53 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  57.5 
 
 		 164 aa  141  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  51.54 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  50.76 
 
 		 167 aa  140  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 		 198 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  51.16 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  51.43 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  50.4 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  51.97 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 		 180 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  49.63 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  52.24 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  51.91 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  49.24 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 		 161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  51.18 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  53.54 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 171 aa  137  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  48.18 
 
 		 171 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  48.51 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3185  protein-methionine-S-oxide reductase  47.62 
 
 		 191 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0351258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  47.33 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55.65 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  53.73 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  48.44 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 169 aa  135  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  48.92 
 
 		 189 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  45.45 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  46.1 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  53.72 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  48.85 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  49.21 
 
 		 136 aa  133  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  49.23 
 
 		 136 aa  133  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  48.87 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  48.15 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  50 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  50.79 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  53.6 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  53.6 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  49.62 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  45.93 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  48.41 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2822  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  48.87 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  47.06 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  48.85 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>