More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2709 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 158 aa  327  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  64.42 
 
 		 167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  63.41 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  61.73 
 
 		 166 aa  208  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  62.82 
 
 		 151 aa  209  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  60.12 
 
 		 166 aa  207  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  58.14 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  64.38 
 
 		 176 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  64.38 
 
 		 176 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  60.25 
 
 		 167 aa  203  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  64.38 
 
 		 176 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  68.18 
 
 		 165 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  56.71 
 
 		 164 aa  197  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  54.44 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  61.88 
 
 		 168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  58.64 
 
 		 167 aa  194  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  70.97 
 
 		 161 aa  194  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  58.39 
 
 		 198 aa  193  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  59.26 
 
 		 167 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  61.15 
 
 		 167 aa  191  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  58.18 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  65.65 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  68 
 
 		 168 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  62.88 
 
 		 174 aa  189  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  64.66 
 
 		 152 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  65.15 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  61.97 
 
 		 171 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  55.09 
 
 		 167 aa  187  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  53.61 
 
 		 190 aa  187  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  58.08 
 
 		 171 aa  186  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  54.37 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  55.06 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  56.13 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  56.88 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  52.83 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  65.35 
 
 		 171 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  62.07 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  53.05 
 
 		 164 aa  181  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  61.38 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  53.46 
 
 		 164 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 		 163 aa  177  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  63.78 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  63.78 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 		 137 aa  176  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  51.57 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  68.18 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  53.46 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  50.32 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  55.9 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  63.93 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  63.93 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.98 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  53.05 
 
 		 168 aa  164  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  54.81 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  49.39 
 
 		 167 aa  160  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  50.96 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  55.3 
 
 		 183 aa  157  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  56.91 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  50.34 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.79 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  57.02 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  48.98 
 
 		 180 aa  150  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  53.49 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 136 aa  147  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0879  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 135 aa  147  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  51.16 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 		 177 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  51.16 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  48.84 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  56.2 
 
 		 229 aa  144  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  52.34 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  51.64 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 		 138 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>