More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1907 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 134 aa  283  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  84.21 
 
 		 134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  84.21 
 
 		 134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  73.23 
 
 		 149 aa  203  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  58.46 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  61.54 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  60.58 
 
 		 136 aa  160  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  59.23 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 		 138 aa  156  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  59.38 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 		 167 aa  153  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 		 198 aa  153  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  54.41 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  55.8 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  59.68 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  53.03 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 167 aa  150  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  55.04 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  57.46 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 164 aa  148  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 185 aa  146  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  56.25 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  52.71 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  58.54 
 
 		 140 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  54.33 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  52.76 
 
 		 136 aa  141  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  52.63 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  55.64 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 137 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 174 aa  140  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 180 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  48.12 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  50.36 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 180 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  51.16 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 133 aa  136  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  54.33 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  49.64 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  51.15 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  50.39 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  50.76 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  51.13 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  52.38 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  47.01 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  55.28 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  51.56 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  52.5 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  53.17 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  53.23 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  53.08 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  52.03 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>