More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4459 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 165 aa  344  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  85.54 
 
 		 166 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  91.52 
 
 		 165 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  90.91 
 
 		 165 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  76.61 
 
 		 171 aa  269  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  76.33 
 
 		 167 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  64.6 
 
 		 161 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  66.87 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  59.76 
 
 		 190 aa  213  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  63.8 
 
 		 160 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  71.01 
 
 		 176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  71.01 
 
 		 176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  71.01 
 
 		 176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  64.94 
 
 		 176 aa  210  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  63.16 
 
 		 174 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  74.02 
 
 		 171 aa  206  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  74.02 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  72.52 
 
 		 174 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  59.15 
 
 		 167 aa  205  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  68.84 
 
 		 171 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  60.87 
 
 		 198 aa  200  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  59.76 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  59.88 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  55.15 
 
 		 166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  59.12 
 
 		 161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  59.26 
 
 		 167 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  60.26 
 
 		 152 aa  197  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  61.04 
 
 		 167 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  61.39 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  57.93 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  58.75 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  61.15 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  71.67 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  65.77 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  56.1 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  56.44 
 
 		 167 aa  186  9e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  64.66 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  56.05 
 
 		 151 aa  180  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  58.82 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  66.94 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  53.25 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  54.55 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  53.9 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  60.74 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  52.5 
 
 		 164 aa  170  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  61.11 
 
 		 137 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  65.04 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  63.71 
 
 		 136 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  65.04 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  52.6 
 
 		 167 aa  167  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  63.71 
 
 		 138 aa  167  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  62.2 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  61.6 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 131 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  61.6 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  57.43 
 
 		 155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  60.58 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 136 aa  163  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  53.57 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  55.97 
 
 		 141 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 		 136 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  56.76 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 		 138 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  60.16 
 
 		 130 aa  160  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 183 aa  159  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  59.06 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 142 aa  157  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  53.55 
 
 		 168 aa  156  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 202 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 		 136 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  55.38 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 139 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  55.91 
 
 		 134 aa  154  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  56.69 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  55.07 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  54.68 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 131 aa  151  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 146 aa  151  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 135 aa  150  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 		 137 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  59.13 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 189 aa  148  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  51.47 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  50.38 
 
 		 135 aa  148  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>