More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1533 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
167 aa  342  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  91.02 
 
 
167 aa  318  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  92.22 
 
 
198 aa  317  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  65.43 
 
 
167 aa  217  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  67.08 
 
 
166 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  60.24 
 
 
171 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  69.12 
 
 
174 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  60.82 
 
 
174 aa  204  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  60.12 
 
 
176 aa  204  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  67.41 
 
 
165 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  58.93 
 
 
190 aa  199  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  58.64 
 
 
167 aa  198  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  58.18 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  64.23 
 
 
165 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  60.12 
 
 
171 aa  197  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  66.42 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  66.42 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  66.42 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  66.17 
 
 
165 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  58.64 
 
 
158 aa  194  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  70.31 
 
 
171 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  55.42 
 
 
164 aa  193  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  55.49 
 
 
164 aa  193  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  67.91 
 
 
137 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  67.65 
 
 
138 aa  190  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  67.65 
 
 
138 aa  190  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  58.54 
 
 
167 aa  190  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  63.16 
 
 
152 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  68.18 
 
 
171 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  65.94 
 
 
138 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  59.33 
 
 
155 aa  187  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  62.25 
 
 
161 aa  187  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  58.64 
 
 
161 aa  186  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  57.32 
 
 
161 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  54.27 
 
 
169 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  59.03 
 
 
151 aa  185  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  61.65 
 
 
138 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  61.65 
 
 
138 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  67.46 
 
 
137 aa  184  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  57.93 
 
 
160 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  67.74 
 
 
136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  58.64 
 
 
163 aa  180  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  62.41 
 
 
135 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  55.83 
 
 
161 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  56.88 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  66.67 
 
 
141 aa  176  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55.21 
 
 
168 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  63.71 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  62.12 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  61.9 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  57.24 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  53.16 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  49.39 
 
 
167 aa  171  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  63.11 
 
 
164 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  60.74 
 
 
157 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  64 
 
 
164 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 
136 aa  168  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  60.9 
 
 
155 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  56.64 
 
 
151 aa  167  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  59.38 
 
 
146 aa  167  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  61.11 
 
 
157 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  60.48 
 
 
168 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  63.64 
 
 
155 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  63.28 
 
 
134 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  63.28 
 
 
134 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 
136 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  57.14 
 
 
140 aa  163  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  56.3 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  61.48 
 
 
130 aa  160  9e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  66.67 
 
 
156 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
149 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 
159 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
133 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  60.34 
 
 
127 aa  158  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
180 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 
137 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  51.33 
 
 
180 aa  157  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  55.38 
 
 
202 aa  157  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  56.15 
 
 
142 aa  157  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  58.54 
 
 
135 aa  156  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 
134 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.63 
 
 
148 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 
137 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 
131 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 
138 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 
131 aa  153  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
131 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 
183 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 
132 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 
140 aa  151  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
140 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  60.83 
 
 
140 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 
131 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
139 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  61.67 
 
 
140 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 
131 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 
189 aa  147  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>