More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1780 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 229 aa  475  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  55.8 
 
 		 165 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  61.6 
 
 		 157 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 164 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  59.85 
 
 		 168 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  58.68 
 
 		 152 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  57.5 
 
 		 166 aa  154  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  54.81 
 
 		 165 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  56.82 
 
 		 167 aa  151  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  55.07 
 
 		 165 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  56.82 
 
 		 168 aa  151  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  52.52 
 
 		 166 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  56.3 
 
 		 164 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  56.78 
 
 		 138 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  53.73 
 
 		 167 aa  148  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  56.78 
 
 		 138 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 		 166 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  57.85 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  57.85 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  58.33 
 
 		 168 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  59.32 
 
 		 164 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  57.02 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  58.62 
 
 		 155 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 176 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  57.72 
 
 		 176 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 176 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 174 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 		 171 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  57.02 
 
 		 161 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  58.47 
 
 		 164 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  56.2 
 
 		 158 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  57.76 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  56.3 
 
 		 168 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  57.63 
 
 		 155 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 167 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  55.83 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  57.02 
 
 		 171 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  55.93 
 
 		 138 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  55.93 
 
 		 138 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  57.02 
 
 		 171 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 		 163 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  55.37 
 
 		 136 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  54.24 
 
 		 137 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  53.39 
 
 		 137 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 		 138 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  50.79 
 
 		 167 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  52.59 
 
 		 183 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  52.1 
 
 		 169 aa  131  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  50.41 
 
 		 151 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  52.5 
 
 		 131 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  55.96 
 
 		 127 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  52.54 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  48.09 
 
 		 159 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  49.26 
 
 		 141 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 155 aa  128  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  47.54 
 
 		 130 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  48.82 
 
 		 160 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  49.22 
 
 		 148 aa  125  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2945  methionine-R-sulfoxide reductase  57.52 
 
 		 141 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2558  methionine-R-sulfoxide reductase  57.52 
 
 		 141 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0971304  normal  0.867883 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  50.4 
 
 		 142 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  48.8 
 
 		 135 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 		 142 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  46.58 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  57 
 
 		 156 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  47.41 
 
 		 131 aa  121  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  49.19 
 
 		 157 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  50.41 
 
 		 135 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  47.76 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 		 137 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  48.33 
 
 		 167 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  44.62 
 
 		 140 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 136 aa  118  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  51.28 
 
 		 142 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  44.62 
 
 		 140 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  49.59 
 
 		 137 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  46.03 
 
 		 128 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  49.58 
 
 		 138 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  47.93 
 
 		 136 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0879  methionine-R-sulfoxide reductase  51.3 
 
 		 135 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  50.45 
 
 		 137 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  45.67 
 
 		 146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  45.24 
 
 		 128 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  47.15 
 
 		 136 aa  115  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  48.78 
 
 		 141 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  47.9 
 
 		 137 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  48.74 
 
 		 139 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  50.41 
 
 		 132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  46.15 
 
 		 142 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  45.6 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  45.31 
 
 		 137 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>