More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1342 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
155 aa  323  5e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  97.42 
 
 
155 aa  315  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  68.87 
 
 
168 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  68.87 
 
 
168 aa  218  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  64.14 
 
 
164 aa  206  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 
167 aa  204  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  61.54 
 
 
164 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  62.07 
 
 
164 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  61.49 
 
 
164 aa  197  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  69.84 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  60.27 
 
 
164 aa  189  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  61.38 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  57.43 
 
 
157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  54.55 
 
 
168 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  60.45 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
202 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  62.88 
 
 
176 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  62.88 
 
 
176 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  62.88 
 
 
176 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  62.6 
 
 
176 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  60.9 
 
 
167 aa  167  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  63.93 
 
 
161 aa  167  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  59.26 
 
 
166 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  53.95 
 
 
167 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  56.52 
 
 
174 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.42 
 
 
166 aa  165  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  62.81 
 
 
198 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  57.93 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  55.7 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  55.41 
 
 
166 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  58.87 
 
 
167 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  61.67 
 
 
152 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 
171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  57.78 
 
 
171 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  53.42 
 
 
167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 
171 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
190 aa  160  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 
167 aa  160  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  56.55 
 
 
165 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 
169 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 
174 aa  157  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
171 aa  156  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 
161 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  51.33 
 
 
164 aa  153  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
137 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  56.56 
 
 
151 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  59.66 
 
 
164 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  59.5 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  53.33 
 
 
137 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  56.8 
 
 
157 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 
161 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  58.68 
 
 
138 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  58.68 
 
 
138 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 
160 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
138 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  56.35 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  51.45 
 
 
153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  65.09 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  58.62 
 
 
229 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  55.83 
 
 
138 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  55.83 
 
 
138 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 
183 aa  143  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  58.04 
 
 
127 aa  142  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.21 
 
 
155 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
147 aa  140  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 
136 aa  140  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
180 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  54.92 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  55.37 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 
131 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  48.57 
 
 
180 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  52.89 
 
 
142 aa  137  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 
136 aa  136  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 
136 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  48.46 
 
 
131 aa  133  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 
133 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  51.61 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  52.89 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0879  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 
135 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  45.64 
 
 
180 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  44.59 
 
 
185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  48.85 
 
 
141 aa  130  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
140 aa  130  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  49.24 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  46.43 
 
 
148 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  50.79 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  52.42 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  48.78 
 
 
135 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  48.87 
 
 
148 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  49.18 
 
 
141 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  47.33 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  48.41 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  44.3 
 
 
177 aa  127  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  46.88 
 
 
132 aa  127  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>