More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1695 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 153 aa  317  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  79.87 
 
 		 154 aa  236  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  60.13 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 165 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  59.24 
 
 		 165 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  64 
 
 		 176 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  64 
 
 		 176 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  64 
 
 		 176 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  67.67 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  64.18 
 
 		 165 aa  183  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  63.43 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  59.44 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  70.63 
 
 		 171 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  55.7 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  70.63 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  62.6 
 
 		 171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  65.89 
 
 		 174 aa  180  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  66.2 
 
 		 171 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  55.62 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  61.27 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  55.69 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  58.22 
 
 		 198 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  57.24 
 
 		 167 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  61.36 
 
 		 167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 190 aa  165  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  54.48 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  62.4 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  57.58 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  53.05 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 167 aa  158  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  50.96 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  52.87 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  52.83 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 164 aa  150  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  56.91 
 
 		 161 aa  150  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 185 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  51.45 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 		 137 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  56.2 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  58.4 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  48.39 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  58.4 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  49.24 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  55.47 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  49.24 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 		 136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  51.2 
 
 		 202 aa  143  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  51.45 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  51.85 
 
 		 168 aa  143  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  49.25 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  56.67 
 
 		 142 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  48.15 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  54.4 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  53.85 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  46.91 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 131 aa  140  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  55.37 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  49.24 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  59.66 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  55.73 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 		 189 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  58.41 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  51.11 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  52.85 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  52.03 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  58.82 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  54.1 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  58.04 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>