More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5395 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 174 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  67.24 
 
 		 174 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  67.43 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  67.95 
 
 		 166 aa  226  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  77.08 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  77.08 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  77.08 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  66.47 
 
 		 167 aa  221  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  63.95 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  76.56 
 
 		 171 aa  210  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  59.76 
 
 		 171 aa  207  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  62.72 
 
 		 167 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  69.66 
 
 		 171 aa  205  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  72.52 
 
 		 165 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  70.23 
 
 		 167 aa  204  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  69.47 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  70.23 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  62.42 
 
 		 198 aa  200  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  67.65 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  69.17 
 
 		 161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  60.37 
 
 		 161 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  67.65 
 
 		 167 aa  197  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  68.42 
 
 		 160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  73.23 
 
 		 161 aa  194  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  55.23 
 
 		 166 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  64.58 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  70.97 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  55.69 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 167 aa  188  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  59.7 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  56.89 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  56.29 
 
 		 152 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  66.17 
 
 		 154 aa  183  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  55.41 
 
 		 169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  56.97 
 
 		 153 aa  180  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  52.47 
 
 		 164 aa  177  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 		 164 aa  177  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  62.69 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  64.57 
 
 		 135 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  57.35 
 
 		 151 aa  174  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  63.49 
 
 		 137 aa  173  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  68.55 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  50.3 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  65.87 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  71.17 
 
 		 156 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  53.05 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 		 138 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 		 138 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  66.39 
 
 		 138 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  66.39 
 
 		 138 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  52.87 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  62.1 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  56.43 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  55.03 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  54.49 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  51.32 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  55.07 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  54.29 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 		 136 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  55 
 
 		 164 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 131 aa  160  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  55.8 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  53.24 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  50.31 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  56.59 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.05 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  55.8 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 		 135 aa  157  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  52.08 
 
 		 151 aa  157  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  50.32 
 
 		 202 aa  156  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  59.5 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  52.41 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  56.8 
 
 		 157 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  56.92 
 
 		 136 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  59.35 
 
 		 135 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  59.84 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 		 128 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 140 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  54.96 
 
 		 133 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  54.89 
 
 		 137 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 		 128 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  58.54 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 146 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  56.39 
 
 		 145 aa  151  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 136 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>