More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1706 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 149 aa  314  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  77.69 
 
 		 134 aa  219  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  77.69 
 
 		 134 aa  219  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  73.23 
 
 		 134 aa  203  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  64.12 
 
 		 148 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  61.54 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  58.65 
 
 		 146 aa  167  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  58.96 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  58.99 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 167 aa  159  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  54.42 
 
 		 164 aa  159  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  56.43 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  60.94 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  58.14 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  57.36 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  56.92 
 
 		 159 aa  154  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  56.72 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  56.92 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 136 aa  153  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  56.59 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  54.89 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  53.96 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  53.73 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 133 aa  151  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  59.06 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  57.14 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  56.39 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  52.59 
 
 		 166 aa  148  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  57.36 
 
 		 133 aa  147  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  53.73 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  56.15 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  51.82 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  56.25 
 
 		 138 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  51.06 
 
 		 166 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  56.92 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.73 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 177 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2822  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  51.77 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  56.15 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  51.91 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  52.99 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  54.14 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  56.35 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  51.82 
 
 		 165 aa  143  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  52.31 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  52.31 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 189 aa  143  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  51.82 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  52.8 
 
 		 157 aa  141  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  52.27 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.15 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  52.59 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  51.8 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  49.32 
 
 		 171 aa  140  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  55.12 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  53.17 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  52.85 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 		 174 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 180 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  52.31 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  51.88 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>