More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1780 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  100 
 
 		 131 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  88.46 
 
 		 131 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  80.92 
 
 		 131 aa  235  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  77.1 
 
 		 131 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  78.63 
 
 		 133 aa  230  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  77.1 
 
 		 131 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  76.34 
 
 		 131 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  63.36 
 
 		 131 aa  189  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  65.65 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  64.12 
 
 		 132 aa  186  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  62.6 
 
 		 133 aa  186  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  65.35 
 
 		 159 aa  183  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  62.31 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  62.31 
 
 		 135 aa  177  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  59.23 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  60.94 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  63.28 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  62.5 
 
 		 137 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  64.29 
 
 		 136 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  64.23 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  60.32 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  60.32 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  60.47 
 
 		 138 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  60.94 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 136 aa  167  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  58.02 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  57.14 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 		 131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  57.25 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  58.4 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 133 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 		 146 aa  161  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  59.4 
 
 		 135 aa  160  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  58.4 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  58.54 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 189 aa  158  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 		 167 aa  157  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  57.25 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 		 137 aa  156  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 130 aa  157  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  62.93 
 
 		 135 aa  156  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 183 aa  156  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 185 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  56.91 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  59.68 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  57.48 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  56.56 
 
 		 147 aa  153  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  58.14 
 
 		 150 aa  153  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  57.03 
 
 		 139 aa  153  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  56.35 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 		 146 aa  150  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  57.6 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  57.14 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>