More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1767 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  100 
 
 
138 aa  291  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  67.72 
 
 
140 aa  197  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  67.72 
 
 
140 aa  197  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  69.35 
 
 
128 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  68.5 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  69.35 
 
 
128 aa  194  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  66.93 
 
 
135 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
143 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  66.93 
 
 
136 aa  191  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  66.67 
 
 
143 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
143 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
143 aa  189  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  65.93 
 
 
143 aa  189  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  66.94 
 
 
128 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  65.19 
 
 
143 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  64.93 
 
 
143 aa  187  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  68.5 
 
 
130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  62.41 
 
 
136 aa  181  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  62.41 
 
 
136 aa  181  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  62.12 
 
 
136 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  60.47 
 
 
131 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  59.85 
 
 
135 aa  173  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  60.43 
 
 
151 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  64.89 
 
 
137 aa  173  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  60.43 
 
 
143 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  60.43 
 
 
143 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  60.45 
 
 
143 aa  173  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  60.43 
 
 
143 aa  172  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  64.29 
 
 
132 aa  172  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  59.71 
 
 
161 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  59.71 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  61.65 
 
 
137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  61.65 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  61.24 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  59.71 
 
 
143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  61.24 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  63.36 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  63.36 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  58.91 
 
 
133 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  60.47 
 
 
131 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 
131 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  58.59 
 
 
131 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 
131 aa  166  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 
134 aa  166  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  55.8 
 
 
138 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  59.35 
 
 
141 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 
133 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  55.97 
 
 
146 aa  164  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  55.04 
 
 
131 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  56.2 
 
 
137 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 
159 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  56.8 
 
 
132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  56.2 
 
 
137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  55.97 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  57.6 
 
 
133 aa  161  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 
137 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 
134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  61.29 
 
 
137 aa  160  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  57.48 
 
 
135 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 
136 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  58.59 
 
 
131 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  51.09 
 
 
155 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  54.01 
 
 
148 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  58.59 
 
 
133 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  57.36 
 
 
133 aa  158  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  57.94 
 
 
140 aa  157  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  56 
 
 
134 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  59.38 
 
 
133 aa  157  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 
131 aa  157  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  58.14 
 
 
132 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  54.74 
 
 
137 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  59.68 
 
 
135 aa  156  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
147 aa  156  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  55.22 
 
 
141 aa  156  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  155  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  58.47 
 
 
137 aa  155  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  155  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  58.47 
 
 
137 aa  155  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  155  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  155  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  155  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  155  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 
137 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  51.82 
 
 
136 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  56.59 
 
 
132 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
142 aa  154  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 
131 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  52.21 
 
 
166 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 
137 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  53.49 
 
 
139 aa  154  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 
133 aa  153  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  51.09 
 
 
137 aa  153  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 
138 aa  152  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.24 
 
 
140 aa  152  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>