More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 131 aa  273  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  80.8 
 
 		 133 aa  220  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  76.98 
 
 		 133 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  75.4 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  67.2 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  64.57 
 
 		 133 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 		 148 aa  173  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  62.99 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  62.2 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  57.25 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  65.32 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  63.71 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  63.71 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  58.73 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  64.46 
 
 		 171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  60 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  64.46 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  62.9 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  63.64 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  58.4 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  63.64 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  58.73 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  56.8 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  57.6 
 
 		 135 aa  150  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 		 137 aa  147  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  56.1 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  50.78 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 165 aa  146  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  51.59 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  51.91 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  53.6 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 171 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  52.85 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 171 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 		 132 aa  143  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  52.85 
 
 		 141 aa  143  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  52.42 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  51.94 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  50.79 
 
 		 138 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 134 aa  140  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  54.03 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 134 aa  140  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  56.56 
 
 		 180 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>