More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1893 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 140 aa  292  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  76.19 
 
 		 133 aa  203  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  75.59 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  74.62 
 
 		 133 aa  200  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  71.65 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  70.45 
 
 		 141 aa  196  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  66.15 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  67.46 
 
 		 149 aa  180  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  66.41 
 
 		 136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  66.41 
 
 		 136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  66.41 
 
 		 136 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  64.84 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  64.84 
 
 		 136 aa  177  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  62.22 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  64.18 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  64.06 
 
 		 136 aa  174  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  59.56 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  58.82 
 
 		 146 aa  170  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  63.71 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  63.57 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  56.62 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  57.97 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  56.3 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  56.93 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 171 aa  157  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  57.25 
 
 		 136 aa  157  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  58.02 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  55.91 
 
 		 139 aa  153  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  53.49 
 
 		 134 aa  150  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  51.13 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  52.55 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  52.31 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  52.31 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  53.33 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  50.77 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  54.76 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 131 aa  143  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  51.91 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  51.49 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  53.38 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  51.15 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  50.38 
 
 		 136 aa  139  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  52.31 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  45.99 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  50.76 
 
 		 136 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  51.88 
 
 		 133 aa  136  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 		 140 aa  136  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  48.89 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  50.76 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  53.54 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  48.87 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  45.52 
 
 		 189 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  51.16 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  47.76 
 
 		 140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  49.23 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 		 133 aa  133  9e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  47.01 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01932  methionine-R-sulfoxide reductase SelR, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07840)  48.2 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  49.64 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  51.97 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  47.29 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  49.25 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  50.75 
 
 		 131 aa  131  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  50.36 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  52.76 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  46.92 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  49.24 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  48.51 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>