More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1542 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  90.98 
 
 		 136 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  65.65 
 
 		 133 aa  177  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  63.78 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  68.75 
 
 		 135 aa  173  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  65.89 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  61.54 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  64.06 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  64.06 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  63.91 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  62.31 
 
 		 161 aa  166  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  63.85 
 
 		 133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  60.31 
 
 		 140 aa  163  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  62.4 
 
 		 146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  57.97 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  60.47 
 
 		 136 aa  160  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  64.23 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  61.24 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  58.02 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  63.2 
 
 		 136 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 		 136 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 		 136 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 		 144 aa  153  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  54.69 
 
 		 134 aa  150  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 136 aa  147  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  53.44 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  51.97 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  51.47 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  50.81 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.63 
 
 		 287 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  52.71 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  54.62 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  51.91 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  51.91 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  53.1 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  50.76 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.08 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  55.12 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.9 
 
 		 286 aa  134  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  52.21 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  52.21 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03070  methionine sulfoxide reductase B  58.2 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  53.85 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  48.46 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.03 
 
 		 334 aa  134  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  50.76 
 
 		 132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 147 aa  131  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  49.25 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  50.36 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.39 
 
 		 333 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  48.51 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.26 
 
 		 306 aa  131  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  50.4 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 140 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  48.39 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  48.85 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  50.76 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  48.12 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  50.76 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  47.62 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  48.84 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  46.67 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  48.15 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  52.17 
 
 		 169 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  48.78 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>