More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0746 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
286 aa  594  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.54 
 
 
334 aa  350  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.39 
 
 
290 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.9 
 
 
338 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.63 
 
 
287 aa  335  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.28 
 
 
333 aa  331  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.7 
 
 
284 aa  331  9e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.36 
 
 
284 aa  329  3e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.23 
 
 
284 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.77 
 
 
334 aa  323  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.74 
 
 
306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.83 
 
 
351 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.28 
 
 
289 aa  302  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.28 
 
 
289 aa  298  5e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.36 
 
 
301 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.71 
 
 
301 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
301 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.64 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.56 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.46 
 
 
301 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.82 
 
 
301 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.46 
 
 
302 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.54 
 
 
301 aa  278  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.46 
 
 
301 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.52 
 
 
301 aa  275  9e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.41 
 
 
305 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.83 
 
 
309 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.07 
 
 
301 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.48 
 
 
305 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  65 
 
 
173 aa  229  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.86 
 
 
322 aa  215  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.34 
 
 
311 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  68.1 
 
 
124 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  62.93 
 
 
124 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  50.93 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  66.07 
 
 
119 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  65.18 
 
 
119 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  64.29 
 
 
119 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  60.53 
 
 
121 aa  162  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  62.61 
 
 
169 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  52 
 
 
181 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  51.33 
 
 
155 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  61.48 
 
 
120 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000598889  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  62.93 
 
 
159 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  46.84 
 
 
158 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2423  methionine sulfoxide reductase B  58.97 
 
 
122 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55047  normal  0.248958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  47.2 
 
 
225 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 
185 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  50.66 
 
 
162 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  44.94 
 
 
178 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  45.51 
 
 
197 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 
163 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  48.08 
 
 
156 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  43.95 
 
 
186 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
191 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  41.86 
 
 
201 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  47.33 
 
 
164 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  46.75 
 
 
162 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  45.12 
 
 
165 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1329  Methionine sulfoxide reductase B  57.66 
 
 
148 aa  146  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.397039  normal  0.253282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44 
 
 
186 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  46.26 
 
 
176 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  40.86 
 
 
219 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  44.87 
 
 
228 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  51.72 
 
 
220 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  44.08 
 
 
179 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 
165 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  50.68 
 
 
150 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  47.77 
 
 
221 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09051  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 
242 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  36.73 
 
 
213 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  44.52 
 
 
162 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  46.67 
 
 
182 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  44.3 
 
 
178 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 
212 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  46.67 
 
 
181 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  44.16 
 
 
175 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  45.7 
 
 
180 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  43.1 
 
 
212 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1809  peptide methionine sulfoxide reductase  49.65 
 
 
157 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.820755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  43.87 
 
 
158 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  43.1 
 
 
212 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10381  peptide methionine sulfoxide reductase  40.45 
 
 
242 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.794772  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  42.5 
 
 
209 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  43.1 
 
 
212 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 
177 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  45.95 
 
 
153 aa  142  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  48.59 
 
 
222 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 
186 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  44.37 
 
 
179 aa  142  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  43.67 
 
 
183 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  45.11 
 
 
218 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  42.95 
 
 
182 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09031  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 
242 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  45.11 
 
 
218 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  45.24 
 
 
220 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  43.68 
 
 
219 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  44.97 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0844  peptide methionine sulfoxide reductase  40.31 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  43.24 
 
 
218 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>