More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1329 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1329  Methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
148 aa  303  8.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.397039  normal  0.253282 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.53 
 
 
301 aa  156  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.53 
 
 
301 aa  156  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.53 
 
 
301 aa  156  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  58.93 
 
 
169 aa  153  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.34 
 
 
334 aa  152  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.41 
 
 
301 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  56.64 
 
 
119 aa  150  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.89 
 
 
301 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  55.75 
 
 
119 aa  150  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.65 
 
 
300 aa  150  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  55.75 
 
 
119 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.41 
 
 
305 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.85 
 
 
284 aa  148  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.47 
 
 
333 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.04 
 
 
301 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.89 
 
 
301 aa  147  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.04 
 
 
301 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.04 
 
 
302 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.82 
 
 
334 aa  147  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.14 
 
 
290 aa  147  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.66 
 
 
286 aa  146  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.42 
 
 
305 aa  146  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.14 
 
 
301 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  55.65 
 
 
120 aa  144  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000598889  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.39 
 
 
309 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  58.56 
 
 
124 aa  140  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  56.76 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.65 
 
 
301 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.47 
 
 
351 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2423  methionine sulfoxide reductase B  55.86 
 
 
122 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55047  normal  0.248958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 
121 aa  137  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.76 
 
 
338 aa  137  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.04 
 
 
306 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.79 
 
 
287 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58 
 
 
284 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58 
 
 
284 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  45.04 
 
 
159 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  52.59 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.33 
 
 
289 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.33 
 
 
289 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
136 aa  122  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  49.17 
 
 
133 aa  120  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
133 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 
142 aa  120  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  54.29 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  48.76 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  46.4 
 
 
140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  46.32 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  49.15 
 
 
133 aa  116  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  48.31 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  40 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  46.03 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  50.4 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  37.69 
 
 
141 aa  111  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  48.76 
 
 
135 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  46.72 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  47.9 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  45.04 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  47.24 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  47.11 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  45.07 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  41.48 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  45.08 
 
 
149 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  47.46 
 
 
136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  46.34 
 
 
180 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  45.83 
 
 
132 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  46.46 
 
 
140 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  47.86 
 
 
171 aa  107  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  44.63 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  41.61 
 
 
180 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  45.87 
 
 
137 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  46.61 
 
 
136 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  43.8 
 
 
178 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  48.62 
 
 
137 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  46.61 
 
 
136 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  46.61 
 
 
136 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  47.46 
 
 
136 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  45.76 
 
 
141 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  46.67 
 
 
136 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  45.45 
 
 
150 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  48.74 
 
 
153 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  45.76 
 
 
134 aa  104  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  43.8 
 
 
144 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  45.9 
 
 
142 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  38.51 
 
 
151 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  43.33 
 
 
136 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  45 
 
 
140 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  41.13 
 
 
143 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  41.67 
 
 
140 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  41.79 
 
 
147 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  41.13 
 
 
143 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  46.3 
 
 
137 aa  103  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  41.13 
 
 
143 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  37.84 
 
 
151 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  41.67 
 
 
140 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  42.5 
 
 
135 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  40.32 
 
 
143 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  47.22 
 
 
137 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>