More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1056 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
124 aa  260  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  86.29 
 
 
124 aa  229  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  63.03 
 
 
121 aa  173  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.71 
 
 
338 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.93 
 
 
286 aa  167  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  62.07 
 
 
169 aa  166  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.37 
 
 
351 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.41 
 
 
284 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.66 
 
 
334 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.93 
 
 
290 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  62.18 
 
 
159 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.18 
 
 
334 aa  158  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  61.06 
 
 
119 aa  158  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2423  methionine sulfoxide reductase B  61.74 
 
 
122 aa  157  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55047  normal  0.248958 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  60.18 
 
 
119 aa  157  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  60.18 
 
 
119 aa  157  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.34 
 
 
333 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.2 
 
 
284 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.2 
 
 
284 aa  154  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.14 
 
 
287 aa  153  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.26 
 
 
301 aa  151  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.26 
 
 
301 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  56.78 
 
 
120 aa  152  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000598889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.26 
 
 
301 aa  151  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.36 
 
 
301 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.76 
 
 
306 aa  149  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.65 
 
 
300 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.46 
 
 
301 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.46 
 
 
301 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.46 
 
 
302 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.46 
 
 
301 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.83 
 
 
301 aa  147  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.56 
 
 
305 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.56 
 
 
301 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55 
 
 
301 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.55 
 
 
309 aa  143  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60 
 
 
305 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.89 
 
 
289 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.89 
 
 
289 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1329  Methionine sulfoxide reductase B  56.76 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.397039  normal  0.253282 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9083  predicted protein  55.08 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  53.78 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 
136 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  52.46 
 
 
136 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 
136 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 
146 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  52.1 
 
 
136 aa  120  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  51.67 
 
 
133 aa  120  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  52.54 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  51.28 
 
 
136 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 
142 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  51.72 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  51.75 
 
 
134 aa  113  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  48.76 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  49.17 
 
 
140 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  51.28 
 
 
133 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  49.17 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  44.92 
 
 
133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  49.57 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  45.9 
 
 
153 aa  107  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  45.08 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  46.72 
 
 
140 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  50.88 
 
 
136 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  46.49 
 
 
131 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01932  methionine-R-sulfoxide reductase SelR, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07840)  56.32 
 
 
153 aa  103  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  44.54 
 
 
133 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  47.86 
 
 
135 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  44.83 
 
 
133 aa  102  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  47.86 
 
 
147 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  43.09 
 
 
145 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  45.76 
 
 
161 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  46.09 
 
 
171 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  44.92 
 
 
159 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  47.79 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  45.69 
 
 
137 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  45.83 
 
 
137 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  47.5 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  41.74 
 
 
148 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  45.22 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  45.3 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  44.72 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  41.13 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  42.98 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  43.33 
 
 
183 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  43.8 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  43.8 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  43.86 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  45.22 
 
 
180 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  45.45 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  46.28 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  44.63 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  45.22 
 
 
198 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  45.3 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  46.61 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  43.48 
 
 
180 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  39.83 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  41.94 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  39.83 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>